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UbuntuのR 3.5.0

Ubuntu Xenial（16.04）のR 3.5.0インストールパッケージは、ubuntuミラーサイトにはまだ存在しません。 ubuntu xenialでRを3.5.0に更新する別の方法はありますか？または、Rを3.5.0に更新する別の方法がありますか？

16.04software-installationr
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Larry

C 3.5のパッケージの一部にはR 3.5でのビルドに問題があるため、R 3.5は現在PPAからのみ利用可能です。

ご自身の責任で進めてください。

私のために働いた手順は次のとおりです。

  1. システムからすべてのr-cran-*パッケージを削除します（YMMV、私は通常ソースからパッケージをインストールしていますが、これらはほとんどありません）

    • dpkg -l | grep r-cran-で検索

  2. 追加 Michael RutterのPPA ：

    Sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter3.5
Sudo apt-get update

  3. Rをアップグレード

    Sudo apt install r-api-3.5

  4. ソースから（install.packages()を介して個人またはサイトライブラリに）必要なすべてのパッケージをインストールするか、対応するr-cran-* Ubuntuパッケージをインストールします。

    次のスクリプトを使用して、R 3.4の個人用サイトライブラリからパッケージをすべて再インストールします。

    installed <- rownames(installed.packages())
pkgs <- dir("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4")
new <- setdiff(pkgs, installed)
new
install.packages(new)

    複数のCPUを搭載したマシンがある場合、次のようにプロセスを高速化できます。

    install.packages(new, Ncpus = 6)

参照資料

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krlmlr

CRANサイトは、6月上旬の@krlmlrの応答以降に更新されました： https://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ 。

CRAN命令にはいくつかのステップがありますが、要約はsources.listファイルはバージョン3.5.xおよび3.6.xに固有のリポジ​​トリを参照する必要があるということです。エントリは次のようなものです

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/

の前の（バージョンレス）エントリの代わりに

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial/

Webサイトからの関連する説明（最終的に変更されます）：

I386およびAMD64上のUbuntuのR 3.6パッケージは、正式なサポート終了日まで、Ubuntuのほとんどの安定したデスクトップリリースで利用できます。ただし、完全にサポートされているのは最新の長期サポート（LTS）リリースのみです。 2018年11月18日の時点で、サポートされるリリースはXenial Xerus（16.04; LTS）、Trusty Tahr（14.04; LTS）、Bionic Beaver（18.04; LTS）、Cosmic Cuttlefish（18.10）、およびDisco Dingo（19.04）です。 R 3.6パッケージをインストールするには、別のsources.listエントリが必要です。詳細は以下をご覧ください。 Rはバージョン3.6に移行しましたが、互換性のために、sources.listエントリはまだcran3.5指定を使用しています。

2019-05-13：R 3.6.0の先月リリースの更新を編集します。

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wibeasley

xenial-cran35/バージョンのレポは、MintなどのUbuntu上で動作する一部のディストリビューションの場合のように、aptに「デフォルトリリース」が設定されている場合は機能しません。私のMintディストリビューションでは、/etc/apt/apt.conf.d/01ubuntuを宣言するファイルDefault-Release "xenial";が存在します。これは、バージョン3.2のubuntuリポジトリにr-baseが存在し、リリース "xenial"で、そのレポのリリース名は「xenial-cran35」であるため、他のレポからの3.6ブランチは使用しません。そのファイルを編集してデフォルトのリリースを「xenail-cran35」に変更するか、apt設定ファイル（ https://wiki.debian.org/AptPreferences#A.2Fetc.2Fapt。 2Fpreferences ）。

これは基本的に、レポジトリのフォーマットが不適切であるというRの責任です。リポジトリには2つのリポジトリがあり、各リポジトリには「xenial」リリースフォルダ、3.2ブランチ作業用のURL、3.5 +ブランチ作業用のURLがあります。代わりに、リポジトリが1つあり、代わりに「リリース名」を粗悪化しました。これはたまたまベースUbuntuで機能しますが、この方法でaptの非ベース構成がある場合は機能しません。

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Scott