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yumを介してec2でRを3.1.1にアップグレードします

Rの古いバージョン（3.0.2）のec2インスタンスがあり、最新（3.1.1）に更新しようとしています。これはデフォルトのyumリポジトリでは使用できませんが、EPELでは使用できます。

インストールされているバージョンは3.0.2です。

[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
Installed Packages
R-core.x86_64                                                                                  3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   @amzn-main
Available Packages
R-core.i686                                                                                    3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   amzn-main

これらはレポです

[hadoop@ip-172-31-19-15 ~]$ yum repolist
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
970 packages excluded due to repository priority protections
repo id                                                                             repo name                                                                                                     status
!amzn-main/latest                                                                   amzn-main-Base                                                                                                     4,801
!amzn-updates/latest                                                                amzn-updates-Base                                                                                                  1,497
epel/x86_64                                                                         Extra Packages for Enterprise Linux 6 - x86_64                                                                10,139+970
repolist: 16,437

Epelリポジトリを指定すると、バージョン3.1.1が表示されますが、これもリストされています ここ

Sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" list R-core
Loaded plugins: priorities, update-motd, upgrade-helper
Installed Packages
R-core.x86_64                                                                                  3.0.2-1.17.amzn1                                                                                   @amzn-main
Available Packages
R-core.i686                                                                                    3.1.1-3.el6                                                                                        epel      
R-core.x86_64                                                                                  3.1.1-3.el6

ただし、Sudo yum --disablerepo="*" --enablerepo="epel" install R-coreを使用してインストールしようとすると、次のエラーが発生します。

--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: R-Java-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: Java-1.5.0-gcj
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicu-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: tcl-devel
Error: Package: R-core-devel-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: tk-devel
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicuuc.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: xdg-utils
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libicui18n.so.42()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libtcl8.5.so()(64bit)
Error: Package: R-core-3.1.1-3.el6.x86_64 (epel)
           Requires: libtk8.5.so()(64bit)
 You could try using --skip-broken to work around the problem
 You could try running: rpm -Va --nofiles --nodigest

おそらくこれは、* repoを無効にし、epelのみを有効にして、一部の依存関係が見つからないようにすることで発生します。そうしないと、amzn_mainから3.0.2しか見つかりません。

Epelリポジトリから3.1.1をインストールするために使用する必要がある正しいコマンドは何ですか？

amazon-ec2yumepel
2
user155695
# yum install yum-priorities

設定されたすべてのリポジトリに優先度を追加する必要があります。 / etc/yum.repos.dに移動し、すべてのファイルを編集してpriorityを追加します。

数値が小さいほど重要です。したがって、EPELのものが最も低くなります。

例：

[epel]
name=Extra Packages for Enterprise Linux 6 - $basearch
#baseurl=http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/$basearch
mirrorlist=https://mirrors.fedoraproject.org/metalink?repo=epel-6&Arch=$basearch
failovermethod=priority
enabled=1
gpgcheck=1
gpgkey=file:///etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-EPEL-6
priority=10
1
George Rushby

EPELはAmazonLinuxと互換性がありません。以前は、Amazon LinuxがCentOSに似ていた非常に初期の頃でしたが、現在はあまりにも異なっています。

0
Michael Hampton