マルチサイトインストールでサイトごとに異なる関数ファイル？
私はマルチサイトWPインストールで同じテーマを使用する2つの（今のところ）サイトを作成しようとしていますが、多少異なる機能を必要とします。
各サイトのfunctions.phpやその他のテーマファイルを上書きするために使用できる方法はありますか？
私はこれのために親子テーマをお勧めします。テーマ内の機能をプラグ可能にする良い例については、以下のリンク先のセクションを読んでください。
同じマルチサイトインストールに異なるテーマを使用できるので、基本的に同じテーマになる新しいテーマフォルダを作成できます。ダッシュボードでこの新しく作成したテーマを有効にするだけで準備完了です。
それからあなたは完全に何の問題もなくWebサイトからWebサイトへのあなたのテーマをカスタマイズすることができます。