_MOTIF_WM_HINTSを使用してみてください...
装飾を削除するには：xprop -f _MOTIF_WM_HINTS 32c -set _MOTIF_WM_HINTS "0x2, 0x0, 0x0, 0x0, 0x0"
装飾を追加するには：xprop -f _MOTIF_WM_HINTS 32c -set _MOTIF_WM_HINTS "0x2, 0x0, 0x1, 0x0, 0x0"
xpropはウィンドウを選択するように求めます。ウィンドウidを知っている場合は、-idパラメーターをxpropに渡すこともできます。マウスを使用してウィンドウのサイズを変更することはできませんが、キーバインドは機能するはずです。