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解析エラー：データフレーム内のJSON列を解析する際の「Trailing Garbage」

this のようなログファイルがあります。

私はMessage列のJSONを次のように解析しようとしています：

library(readr)
library(jsonlite)

df <- read_csv("log_file_from_above.csv")
fromJSON(as.character(df$Message))

ただし、次のエラーが発生します。

Error: parse error: trailing garbage
          "isEmailConfirmed": false  } {    "id": -1,    "firstName": 
                     (right here) ------^

「末尾のゴミ」を取り除くにはどうすればよいですか？

jsonrjsonlitepurrr
16
emehex

fromJSON()は、文字ベクトルに対して「適用」するのではなく、すべてをデータフレームに変換しようとしています。あなたが試すことができます

purrr::map(df$Message, jsonlite::fromJSON)

@Abdouが提供したものまたは

jsonlite::stream_in(textConnection(gsub("\\n", "", df$Message)))

後者の2つはデータフレームを作成します。 1つ目は、列として追加できるリストを作成します。

dplyr::bind_colsで最後のメソッドを使用して、すべてのデータを含む新しいデータフレームを作成できます。

dplyr::bind_cols(df[,1:3],
                 jsonlite::stream_in(textConnection(gsub("\\n", "", df$Message))))

@Abdouによって提案されているのは、ほぼ純粋なベースRソリューションです。

cbind(df, do.call(plyr::rbind.fill, lapply(paste0("[",df$Message,"]"), function(x) jsonlite::fromJSON(x))))

完全で機能するワークフロー：

library(dplyr)
library(jsonlite)

df <- read.table("http://Pastebin.com/raw/MMPMwNZv",
                 quote='"', sep=",", stringsAsFactors=FALSE, header=TRUE)

bind_cols(df[,1:3], stream_in(textConnection(gsub("\\n", "", df$Message)))) %>%
  glimpse()
## 
 Found 3 records...
 Imported 3 records. Simplifying into dataframe...
## Observations: 3
## Variables: 19
## $ Id                  <int> 35054, 35055, 35059
## $ Date                <chr> "2016-06-17 19:29:43 +0000", "2016-06-17 1...
## $ Level               <chr> "INFO", "INFO", "INFO"
## $ id                  <int> -2, -1, -3
## $ ipAddress           <chr> "100.100.100.100", NA, "100.200.300.400"
## $ howYouHearAboutUs   <chr> NA, "Radio", NA
## $ isInterestedInOffer <lgl> TRUE, FALSE, TRUE
## $ incomeRange         <int> 60000, 1, 100000
## $ isEmailConfirmed    <lgl> FALSE, NA, TRUE
## $ firstName           <chr> NA, "John", NA
## $ lastName            <chr> NA, "Smith", NA
## $ email               <chr> NA, "[email protected]", NA
## $ city                <chr> NA, "Smalltown", NA
## $ birthDate           <chr> NA, "1999-12-10T05:00:00Z", NA
## $ password            <chr> NA, "*********", NA
## $ agreeToTermsOfUse   <lgl> NA, TRUE, TRUE
## $ visitUrl            <chr> NA, NA, "https://www.website.com/?purpose=X"
## $ isIdentityConfirmed <lgl> NA, NA, FALSE
## $ validationResults   <lgl> NA, NA, NA
12
hrbrmstr