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実行コマンドがゾンビに変わった後、Dockerコンテナが強制終了を拒否する

まず最初に。私のシステム情報とバージョン:

_$ lsb_release -a
No LSB modules are available.
Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 13.04
Release:    13.04
Codename:   raring

$ Sudo docker version
Client version: 0.9.0
Go version (client): go1.2.1
Git commit (client): 2b3fdf2
Server version: 0.9.0
Git commit (server): 2b3fdf2
Go version (server): go1.2.1

$ lxc-version
lxc version: 0.9.0

$ uname -a
Linux ip-10-0-2-86 3.8.0-19-generic #29-Ubuntu SMP Wed Apr 17 18:16:28 UTC 2013 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
_

コンテナ内のプロセスがゾンビになった後、コンテナを停止できません。 docker 0.9.0にアップグレードした後、サーバー上に大量のゾンビが表示されていました。例:

_$ ps axo stat,ppid,pid,comm | grep -w defunct
Zl   25327 25332 node <defunct>

$ pstree -p
init(1)─┬
        ├─sh(819)───docker(831)─┬
                                ├─lxc-start(25327)───node(25332)───{node}(25378)
_

lxc-start(25327)がノードプロセス25332でwait()を呼び出さず、ゾンビを存続させていることがわかります。そこで、straceで何をしているのかを確認したところ、_epoll_wait_でスタックしているようでした。 stractは実際には最初はスタックし、これを示しています。

_$Sudo strace -ir -ttt -T -v -p 25327
Process 25327 attached - interrupt to quit (when asked to kill)
     0.000103 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, 
_

しかし、Sudo docker kill 3da5764b7bc9358を実行すると、より多くの出力が得られます。

_ 0.000103 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN, {u32=21673408, u64=21673408}}}, 10, 4294967295) = 1 <8.935002>
 8.935097 [    7fe59bcaff60] accept(4, 0, NULL) = 9 <0.000035>
 0.000095 [    7fe59bcafeb3] fcntl(9, F_SETFD, FD_CLOEXEC) = 0 <0.000027>
 0.000083 [    7fe59b9d401a] setsockopt(9, SOL_SOCKET, SO_PASSCRED, [1], 4) = 0 <0.000027>
 0.000089 [    7fe59b9d347a] epoll_ctl(8, EPOLL_CTL_ADD, 9, {EPOLLIN, {u32=21673472, u64=21673472}}) = 0 <0.000023>
 0.000087 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN, {u32=21673472, u64=21673472}}}, 10, 4294967295) = 1 <0.000026>
 0.000090 [    7fe59bcb0130] recvmsg(9, {msg_name(0)=NULL, msg_iov(1)=[{"\3\0\0\0\0\0\0\0", 8}], msg_controllen=32, {cmsg_len=28, cmsg_level=SOL_SOCKET, cmsg_type=SCM_CREDENTIALS{pid=773, uid=0, gid=0}}, msg_flags=0}, 0) = 8 <0.000034>
 0.000128 [    7fe59bcb019d] sendto(9, "\0\0\0\0\0\0\0\0\364b\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0", 24, 0, NULL, 0) = 24 <0.000029>
 0.000090 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN|EPOLLHUP, {u32=21673472, u64=21673472}}}, 10, 4294967295) = 1 <0.000018>
 0.000091 [    7fe59bcb0130] recvmsg(9, {msg_name(0)=NULL, msg_iov(1)=[{"\3\0\0\0\0\0\0\0", 8}], msg_controllen=32, {cmsg_len=28, cmsg_level=SOL_SOCKET, cmsg_type=SCM_CREDENTIALS{pid=0, uid=0, gid=0}}, msg_flags=0}, 0) = 0 <0.000026>
 0.000122 [    7fe59b9d347a] epoll_ctl(8, EPOLL_CTL_DEL, 9, NULL) = 0 <0.000037>
 0.000084 [    7fe59bcafd00] close(9) = 0 <0.000048>
 0.000103 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN, {u32=21673408, u64=21673408}}}, 10, 4294967295) = 1 <1.091839>
 1.091916 [    7fe59bcaff60] accept(4, 0, NULL) = 9 <0.000035>
 0.000093 [    7fe59bcafeb3] fcntl(9, F_SETFD, FD_CLOEXEC) = 0 <0.000027>
 0.000083 [    7fe59b9d401a] setsockopt(9, SOL_SOCKET, SO_PASSCRED, [1], 4) = 0 <0.000026>
 0.000090 [    7fe59b9d347a] epoll_ctl(8, EPOLL_CTL_ADD, 9, {EPOLLIN, {u32=21673504, u64=21673504}}) = 0 <0.000032>
 0.000100 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN, {u32=21673504, u64=21673504}}}, 10, 4294967295) = 1 <0.000028>
 0.000088 [    7fe59bcb0130] recvmsg(9, {msg_name(0)=NULL, msg_iov(1)=[{"\3\0\0\0\0\0\0\0", 8}], msg_controllen=32, {cmsg_len=28, cmsg_level=SOL_SOCKET, cmsg_type=SCM_CREDENTIALS{pid=774, uid=0, gid=0}}, msg_flags=0}, 0) = 8 <0.000030>
 0.000125 [    7fe59bcb019d] sendto(9, "\0\0\0\0\0\0\0\0\364b\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0\0", 24, 0, NULL, 0) = 24 <0.000032>
 0.000119 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8, {{EPOLLIN|EPOLLHUP, {u32=21673504, u64=21673504}}}, 10, 4294967295) = 1 <0.000071>
 0.000139 [    7fe59bcb0130] recvmsg(9, {msg_name(0)=NULL, msg_iov(1)=[{"\3\0\0\0\0\0\0\0", 8}], msg_controllen=32, {cmsg_len=28, cmsg_level=SOL_SOCKET, cmsg_type=SCM_CREDENTIALS{pid=0, uid=0, gid=0}}, msg_flags=0}, 0) = 0 <0.000018>
 0.000112 [    7fe59b9d347a] epoll_ctl(8, EPOLL_CTL_DEL, 9, NULL) = 0 <0.000028>
 0.000076 [    7fe59bcafd00] close(9) = 0 <0.000027>
 0.000096 [    7fe59b9d34b3] epoll_wait(8,
_

次に、ファイル8のように見えるepoll_waitが待機しているものを調べました(これは、epoll_wait(8, {{EPOLLIN, {u32=21673408, u64=21673408}}}, 10, 4294967295) = 1 <8.935002>の形式のint epoll_wait(int epfd, struct epoll_event *events, int maxevents, int timeout);から推測しています。

_$ cat /proc/25327/fdinfo/8
pos:    0
flags:  02000002
tfd:        7 events:       19 data:          14ab830
tfd:        4 events:       19 data:          14ab5c0
_

上記のtfdに基づいて7と4も追加します(tfdが実際に何を意味するのかわかりません)

_$ cat /proc/25327/fdinfo/4
pos:    0
flags:  02000002
$ cat /proc/25327/fdinfo/7
pos:    0
flags:  02000002
sigmask:    fffffffe7ffbfab7
$ cd /proc/25327/fd
$ ls -al
lr-x------ 1 root root 64 Mar 13 22:28 0 -> /dev/null
lrwx------ 1 root root 64 Mar 13 22:28 1 -> /dev/pts/17
lrwx------ 1 root root 64 Mar 13 22:28 2 -> /dev/pts/17
l-wx------ 1 root root 64 Mar 13 22:28 3 -> /var/log/lxc/3da5764b7bc935896a72abc9371ce68d4d658d8c70b56e1090aacb631080ec0e.log
lrwx------ 1 root root 64 Mar 13 22:28 4 -> socket:[48415]
lrwx------ 1 root root 64 Mar 14 00:03 5 -> /dev/ptmx
lrwx------ 1 root root 64 Mar 14 00:03 6 -> /dev/pts/18
lrwx------ 1 root root 64 Mar 14 00:03 7 -> anon_inode:[signalfd]
lrwx------ 1 root root 64 Mar 14 00:03 8 -> anon_inode:[eventpoll]
_

ソケットに関する情報:

_$ Sudo netstat -anp | grep 48415
Proto RefCnt Flags       Type       State         I-Node   PID/Program name    Path
unix  2      [ ACC ]     STREAM     LISTENING     48415    25327/lxc-start     @/var/lib/lxc/3da5764b7bc935896a72abc9371ce68d4d658d8c70b56e1090aacb631080ec0e/command
_

docker.logには共通のパターンがあるようですが、停止しないすべてのコンテナーには次のシグネチャがあります。

_2014/03/16 16:33:15 Container beb71548b3b23ba3337ca30c6c2efcbfcaf19d4638cf3d5ec5b8a3e4c5f1059a failed to exit within 0 seconds of SIGTERM - using the force
2014/03/16 16:33:25 Container SIGKILL failed to exit within 10 seconds of lxc-kill beb71548b3b2 - trying direct SIGKILL
_

この時点で、次に何をすべきかわかりません。これらのコンテナが終了しない原因を見つける方法についての提案はありますか?収集する必要のある他のデータはありますか?また、このプロセスにSIGCHLDを送信しましたが無駄でした。

より多くのデータ:コンテナでstartコマンドを使用して開始するノードプロセスの最後にログを追加しました:

_Mon Mar 17 2014 20:52:52 GMT+0000 (UTC) process: main process = exit code: 0
_

dockerからのログは次のとおりです。

_2014/03/17 20:52:52 Container f8a3d55e0f... failed to exit within 0 seconds of SIGTERM - using the force
2014/03/17 20:53:02 Container SIGKILL failed to exit within 10 seconds of lxc-kill f8a3d55e0fd8 - trying direct SIGKILL
_

タイムスタンプは、プロセスが20:52:52に終了したことを示しています

これは、ネイティブドライバーとlxcdockerドライバーの両方を使用して発生します。

編集:再現手順!

これをbashスクリプトに変換して実行し、コンテナのほぼ50%がゾンビに変わるのを見てください!

_CNT=0
while true
do 
  echo $CNT
  DOCK=$(Sudo docker run -d -t anandkumarpatel/zombie_bug ./node index.js)
  sleep 60 && Sudo docker stop $DOCK > out.log &
  sleep 1
  CNT=$(($CNT+1))
  if [[ "$CNT" == "50" ]]; then
    exit
  fi
done
_
21

最新のカーネルに変更すると問題が修正されます

正確なカーネルの違いが見つかりました:
REPRO:linux-image-3.8.0-31-generic
再現なし:linux-image-3.8.0-32-generic

これが修正だと思います:

+++ linux-3.8.0/kernel/pid_namespace.c
@@ -181,6 +181,7 @@
    int nr;
    int rc;
    struct task_struct *task, *me = current;
+   int init_pids = thread_group_leader(me) ? 1 : 2;

    /* Don't allow any more processes into the pid namespace */
    disable_pid_allocation(pid_ns);
@@ -230,7 +231,7 @@
     */
    for (;;) {
        set_current_state(TASK_UNINTERRUPTIBLE);
-       if (pid_ns->nr_hashed == 1)
+       if (pid_ns->nr_hashed == init_pids)
            break;
        schedule();
    }

ここから来ました: https://groups.google.com/forum/#!msg/fa.linux.kernel/u4b3n4oYDQ4/GuLrXfDIYggJ

これを再現するすべてのサーバーをアップグレードし、それがまだ発生するかどうかを確認します。

13

SLES12で強制終了できないDockerコンテナを監視SP 1(3週間から実行されていた)

オン docker exec -itコマンドに続くエラーメッセージ:

rpcエラー:コード= 13 desc =無効なヘッダーフィールド値 "ociランタイムエラー:execが失敗しました:container_linux.go:247:コンテナプロセスを開始すると\" process_linux.go:83:setnsプロセスを実行すると\ "終了しますステータス16 \\ "\"\n "

Linuxカーネル:3.12.62-60.64.8-デフォルト

Dockerバージョン1.12.2、ビルド8eab29e

1
J. Doe