データベースの削除中に「エラー2013（HY000）：クエリ中にMySQLサーバーへの接続が失われました」
ドロップできない空のデータベースがあります。最初は、SELECTできなかったテーブルが含まれていました。そのため、そのデータベースからすべてのテーブルを削除し、データベースを削除しようとしましたが、成功しませんでした。
mysql> drop database my_database;
ERROR 2013 (HY000): Lost connection to MySQL server during query
これで、サーバーで削除できない空のデータベースができました。
Mysql error.logを確認します。出力は次のとおりです：
130812 10:02:45 InnoDB: Assertion failure in thread 140409656780544 in file row0mysql.c line 3682
InnoDB: Failing assertion: table
InnoDB: We intentionally generate a memory trap.
InnoDB: Submit a detailed bug report to http://bugs.mysql.com.
InnoDB: If you get repeated assertion failures or crashes, even
InnoDB: immediately after the mysqld startup, there may be
InnoDB: corruption in the InnoDB tablespace. Please refer to
InnoDB: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5/en/forcing-innodb-recovery.html
InnoDB: about forcing recovery.
14:02:45 UTC - mysqld got signal 6 ;
This could be because you hit a bug. It is also possible that this binary
or one of the libraries it was linked against is corrupt, improperly built,
or misconfigured. This error can also be caused by malfunctioning hardware.
We will try our best to scrape up some info that will hopefully help
diagnose the problem, but since we have already crashed,
something is definitely wrong and this may fail.
key_buffer_size=16777216
read_buffer_size=131072
max_used_connections=3
max_threads=151
thread_count=3
connection_count=3
It is possible that mysqld could use up to
key_buffer_size + (read_buffer_size + sort_buffer_size)*max_threads = 346685 K bytes of memory
Hope that's ok; if not, decrease some variables in the equation.
Thread pointer: 0x7fb3ad55d030
Attempting backtrace. You can use the following information to find out
where mysqld died. If you see no messages after this, something went
terribly wrong...
stack_bottom = 7fb3abb71e60 thread_stack 0x30000
/usr/sbin/mysqld(my_print_stacktrace+0x29)[0x7fb3ac1516b9]
/usr/sbin/mysqld(handle_fatal_signal+0x3d8)[0x7fb3ac039318]
/lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0xfcb0)[0x7fb3aab96cb0]
/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(gsignal+0x35)[0x7fb3aa1ff425]
/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(abort+0x17b)[0x7fb3aa202b8b]
/usr/sbin/mysqld(+0x561acd)[0x7fb3ac192acd]
/usr/sbin/mysqld(+0x542c63)[0x7fb3ac173c63]
/usr/sbin/mysqld(+0x40837f)[0x7fb3ac03937f]
/usr/sbin/mysqld(_Z24plugin_foreach_with_maskP3THDPFcS0_P13st_plugin_intPvEijS3_+0x165)[0x7fb3abf4daa5]
/usr/sbin/mysqld(_Z11mysql_rm_dbP3THDPcbb+0x300)[0x7fb3abf23580]
/usr/sbin/mysqld(_Z21mysql_execute_commandP3THD+0x203c)[0x7fb3abf418ac]
/usr/sbin/mysqld(+0x31301e)[0x7fb3abf4401e]
/usr/sbin/mysqld(_Z16dispatch_command19enum_server_commandP3THDPcj+0x19e7)[0x7fb3abf46247]
/usr/sbin/mysqld(_Z24do_handle_one_connectionP3THD+0x105)[0x7fb3abfe0405]
/usr/sbin/mysqld(handle_one_connection+0x50)[0x7fb3abfe0520]
/lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0(+0x7e9a)[0x7fb3aab8ee9a]
/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(clone+0x6d)[0x7fb3aa2bcccd]
Trying to get some variables.
Some pointers may be invalid and cause the dump to abort.
Query (7fb388004b90): is an invalid pointer
Connection ID (thread ID): 59
Status: NOT_KILLED
The manual page at http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/crashing.html contains
information that should help you find out what is causing the crash.
130812 10:02:45 [Note] Plugin 'FEDERATED' is disabled.
130812 10:02:45 InnoDB: The InnoDB memory heap is disabled
130812 10:02:45 InnoDB: Mutexes and rw_locks use GCC atomic builtins
130812 10:02:45 InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.7
130812 10:02:45 InnoDB: Using Linux native AIO
130812 10:02:45 InnoDB: Initializing buffer pool, size = 128.0M
130812 10:02:45 InnoDB: Completed initialization of buffer pool
130812 10:02:45 InnoDB: highest supported file format is Barracuda.
130812 10:02:45 InnoDB: Waiting for the background threads to start
130812 10:02:46 InnoDB: 5.5.32 started; log sequence number 25852489043
130812 10:02:46 InnoDB: !!! innodb_force_recovery is set to 4 !!!
130812 10:02:46 [Note] Server hostname (bind-address): '127.0.0.1'; port: 3306
130812 10:02:46 [Note] - '127.0.0.1' resolves to '127.0.0.1';
130812 10:02:46 [Note] Server socket created on IP: '127.0.0.1'.
130812 10:02:46 [Note] Event Scheduler: Loaded 0 events
130812 10:02:46 [Note] /usr/sbin/mysqld: ready for connections.
Version: '5.5.32-0ubuntu0.12.10.1' socket: '/var/run/mysqld/mysqld.sock' port: 3306 (Ubuntu)
設定を入れてみましたinnodb_force_recovery = 4そしてMySQLを再起動しますが、まったく効果がありませんでした。
ここでは、サーバーの再インストールはオプションではありません。多くのマシン（2Ubuntuと2CentOS）で発生しましたが、現在問題を再現できません。
InnoDBテーブルの破損に関係していると思います。私も同様の問題を抱えており、それを1つのテーブルに特定することができました。私はまだテーブルを複製し、私の場合は悪い単一のレコードを削除することで問題を修正している最中です。
このリンクは私を大いに助けました：
答えが不完全で申し訳ありませんが、見つけたらかなり役に立ちました。