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DataFrame / Dataset groupBy動作/最適化

次の列で構成されるDataFrame dfがあるとします。

名前、姓、サイズ、幅、長さ、重量

次に、いくつかの操作を実行します。たとえば、サイズと幅に関するデータを含むいくつかのデータフレームを作成します。

val df1 = df.groupBy("surname").agg( sum("size") )
val df2 = df.groupBy("surname").agg( sum("width") )

お気づきのとおり、Lengthなどの他の列はどこでも使用されていません。 Sparkは、シャッフルフェーズの前に冗長列を削除するのに十分スマートですか、それとも持ち運びされますか?Wil実行中:

val dfBasic = df.select("surname", "size", "width")

グループ化する前に、何らかの形でパフォーマンスに影響がありますか?

30
Niemand

はい、「賢い」です。 groupByに対して実行されるDataFrameは、プレーンなRDDに対して実行されるgroupByと同じ操作ではありません。あなたが説明したシナリオでは、生データを移動する必要はまったくありません。それを説明する小さな例を作ってみましょう:

val df = sc.parallelize(Seq(
   ("a", "foo", 1), ("a", "foo", 3), ("b", "bar", 5), ("b", "bar", 1)
)).toDF("x", "y", "z")

df.groupBy("x").agg(sum($"z")).explain

// == Physical Plan ==
// *HashAggregate(keys=[x#148], functions=[sum(cast(z#150 as bigint))])
// +- Exchange hashpartitioning(x#148, 200)
//    +- *HashAggregate(keys=[x#148], functions=[partial_sum(cast(z#150 as bigint))])
//       +- *Project [_1#144 AS x#148, _3#146 AS z#150]
//          +- *SerializeFromObject [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._1, true, false) AS _1#144, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._2, true, false) AS _2#145, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._3 AS _3#146]
//             +- Scan ExternalRDDScan[obj#143]

できるように、最初のフェーズは、必要な列のみが保持される投影です。次のデータはローカルに集約され、最終的に転送されてグローバルに集約されます。 Spark <= 1.4を使用すると、少し異なる回答出力が得られますが、一般的な構造はまったく同じである必要があります。

最後に、上記の説明が実際のジョブを説明していることを示すDAGの視覚化:

group by and agg DAG

同様に、Dataset.groupByKeyの後にreduceGroupsが続くものには、マップ側(ObjectHashAggregate with partial_reduceaggregator)とリデュース側(ObjectHashAggregate with reduceaggregator reduction):

case class Foo(x: String, y: String, z: Int)

val ds = df.as[Foo]
ds.groupByKey(_.x).reduceGroups((x, y) => x.copy(z = x.z + y.z)).explain

// == Physical Plan ==
// ObjectHashAggregate(keys=[value#126], functions=[reduceaggregator([email protected], Some(newInstance(class $line40.$read$$iw$$iw$Foo)), Some(class $line40.$read$$iw$$iw$Foo), Some(StructType(StructField(x,StringType,true), StructField(y,StringType,true), StructField(z,IntegerType,false))), input[0, scala.Tuple2, true]._1 AS value#128, if ((isnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2) || None.equals)) null else named_struct(x, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).x, true, false) AS x#25, y, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).y, true, false) AS y#26, z, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).z AS z#27) AS _2#129, newInstance(class scala.Tuple2), staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).x, true, false) AS x#25, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).y, true, false) AS y#26, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).z AS z#27, StructField(x,StringType,true), StructField(y,StringType,true), StructField(z,IntegerType,false), true, 0, 0)])
// +- Exchange hashpartitioning(value#126, 200)
//    +- ObjectHashAggregate(keys=[value#126], functions=[partial_reduceaggregator([email protected], Some(newInstance(class $line40.$read$$iw$$iw$Foo)), Some(class $line40.$read$$iw$$iw$Foo), Some(StructType(StructField(x,StringType,true), StructField(y,StringType,true), StructField(z,IntegerType,false))), input[0, scala.Tuple2, true]._1 AS value#128, if ((isnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2) || None.equals)) null else named_struct(x, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).x, true, false) AS x#25, y, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).y, true, false) AS y#26, z, assertnotnull(assertnotnull(input[0, scala.Tuple2, true]._2)).z AS z#27) AS _2#129, newInstance(class scala.Tuple2), staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).x, true, false) AS x#25, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).y, true, false) AS y#26, assertnotnull(assertnotnull(input[0, $line40.$read$$iw$$iw$Foo, true])).z AS z#27, StructField(x,StringType,true), StructField(y,StringType,true), StructField(z,IntegerType,false), true, 0, 0)])
//       +- AppendColumns <function1>, newInstance(class $line40.$read$$iw$$iw$Foo), [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, input[0, Java.lang.String, true], true, false) AS value#126]
//          +- *Project [_1#4 AS x#8, _2#5 AS y#9, _3#6 AS z#10]
//             +- *SerializeFromObject [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._1, true, false) AS _1#4, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._2, true, false) AS _2#5, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._3 AS _3#6]
//                +- Scan ExternalRDDScan[obj#3]

groupByKey + reduceGroups

ただし、KeyValueGroupedDatasetの他のメソッドはRDD.groupByKeyと同様に機能する場合があります。たとえば、mapGroups(またはflatMapGroups)は部分集計を使用しません。

ds.groupByKey(_.x)
  .mapGroups((_, iter) => iter.reduce((x, y) => x.copy(z = x.z + y.z)))
  .explain

//== Physical Plan ==
//*SerializeFromObject [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, $line15.$read$$iw$$iw$Foo, true]).x, true, false) AS x#37, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, $line15.$read$$iw$$iw$Foo, true]).y, true, false) AS y#38, assertnotnull(input[0, $line15.$read$$iw$$iw$Foo, true]).z AS z#39]
//+- MapGroups <function2>, value#32.toString, newInstance(class $line15.$read$$iw$$iw$Foo), [value#32], [x#8, y#9, z#10], obj#36: $line15.$read$$iw$$iw$Foo
//   +- *Sort [value#32 ASC NULLS FIRST], false, 0
//      +- Exchange hashpartitioning(value#32, 200)
//         +- AppendColumns <function1>, newInstance(class $line15.$read$$iw$$iw$Foo), [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, input[0, Java.lang.String, true], true, false) AS value#32]
//            +- *Project [_1#4 AS x#8, _2#5 AS y#9, _3#6 AS z#10]
//               +- *SerializeFromObject [staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._1, true, false) AS _1#4, staticinvoke(class org.Apache.spark.unsafe.types.UTF8String, StringType, fromString, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._2, true, false) AS _2#5, assertnotnull(input[0, scala.Tuple3, true])._3 AS _3#6]
//                  +- Scan ExternalRDDScan[obj#3]

groupByKey + mapGroups

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