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各列に異なる関数を適用してデータフレームをリサンプルするにはどうすればよいですか?

pandas dataframeに温度と放射の時系列があります。時間分解能は通常のステップで1分です。

import datetime
import pandas as pd
import numpy as np

date_times = pd.date_range(datetime.datetime(2012, 4, 5, 8, 0),
                           datetime.datetime(2012, 4, 5, 12, 0),
                           freq='1min')
tamb = np.random.sample(date_times.size) * 10.0
radiation = np.random.sample(date_times.size) * 10.0
frame = pd.DataFrame(data={'tamb': tamb, 'radiation': radiation},
                     index=date_times)
frame
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
DatetimeIndex: 241 entries, 2012-04-05 08:00:00 to 2012-04-05 12:00:00
Freq: T
Data columns:
radiation    241  non-null values
tamb         241  non-null values
dtypes: float64(2)

このdataframeを1時間の解像度にダウンサンプリングして、温度については毎時平均を計算し、輻射については毎時合計を計算するにはどうすればよいですか?

35
bmu

pandas 0.18の場合、リサンプルAPIが変更されました( docs を参照)。したがって、pandas> = 0.18の場合、答えは次のとおりです。

In [31]: frame.resample('1H').agg({'radiation': np.sum, 'tamb': np.mean})
Out[31]: 
                         tamb   radiation
2012-04-05 08:00:00  5.161235  279.507182
2012-04-05 09:00:00  4.968145  290.941073
2012-04-05 10:00:00  4.478531  317.678285
2012-04-05 11:00:00  4.706206  335.258633
2012-04-05 12:00:00  2.457873    8.655838

古い答え:

私はpandas >= 0.8の時系列関連の変更を反映するために私の質問に回答しています(他のすべての回答は古くなっています)。

pandas> = 0.8を使用すると、答えは:

In [30]: frame.resample('1H', how={'radiation': np.sum, 'tamb': np.mean})
Out[30]: 
                         tamb   radiation
2012-04-05 08:00:00  5.161235  279.507182
2012-04-05 09:00:00  4.968145  290.941073
2012-04-05 10:00:00  4.478531  317.678285
2012-04-05 11:00:00  4.706206  335.258633
2012-04-05 12:00:00  2.457873    8.655838
59
bmu

あなたを満足させるために、pandas 0.8.0(GitHubのtimeseriesブランチで大規模な開発が行われています)では、次のことができます。

In [5]: frame.convert('1h', how='mean')
Out[5]: 
                     radiation      tamb
2012-04-05 08:00:00   7.840989  8.446109
2012-04-05 09:00:00   4.898935  5.459221
2012-04-05 10:00:00   5.227741  4.660849
2012-04-05 11:00:00   4.689270  5.321398
2012-04-05 12:00:00   4.956994  5.093980

上記の方法は、パンダの現在の製品バージョンでの正しい戦略です。

3
Wes McKinney

pandas.DateRangeobjectsasofメソッドを使用してダウンサンプリングすることもできます。

In [21]: hourly = pd.DateRange(datetime.datetime(2012, 4, 5, 8, 0),
...                          datetime.datetime(2012, 4, 5, 12, 0),
...                          offset=pd.datetools.Hour())

In [22]: frame.groupby(hourly.asof).size()
Out[22]: 
key_0
2012-04-05 08:00:00    60
2012-04-05 09:00:00    60
2012-04-05 10:00:00    60
2012-04-05 11:00:00    60
2012-04-05 12:00:00    1
In [23]: frame.groupby(hourly.asof).agg({'radiation': np.sum, 'tamb': np.mean})
Out[23]: 
                     radiation  tamb 
key_0                                
2012-04-05 08:00:00  271.54     4.491
2012-04-05 09:00:00  266.18     5.253
2012-04-05 10:00:00  292.35     4.959
2012-04-05 11:00:00  283.00     5.489
2012-04-05 12:00:00  0.5414     9.532
3
Garrett

groupbyをそのまま使用する必要があります。

grouped = frame.groupby(lambda x: x.hour)
grouped.agg({'radiation': np.sum, 'tamb': np.mean})
# Same as: grouped.agg({'radiation': 'sum', 'tamb': 'mean'})

出力は次のとおりです。

        radiation      tamb
key_0                      
8      298.581107  4.883806
9      311.176148  4.983705
10     315.531527  5.343057
11     288.013876  6.022002
12       5.527616  8.507670

つまり、基本的には時間の値で分割し、tambの平均とradiationの合計を計算して、DataFrameを返します(Rのddply)。詳細については、ドキュメントページで groupbythis のブログ投稿を確認します。

編集:このスケールを少し良くするには、次のように曜日と時間の両方でグループ化できます。

grouped = frame.groupby(lambda x: (x.day, x.hour))
grouped.agg({'radiation': 'sum', 'tamb': 'mean'})
          radiation      tamb
key_0                        
(5, 8)   298.581107  4.883806
(5, 9)   311.176148  4.983705
(5, 10)  315.531527  5.343057
(5, 11)  288.013876  6.022002
(5, 12)    5.527616  8.507670
1
diliop