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海の散布図でスポットエッジの色を変更する方法

シーボーンを使用して散布図を作成しました:

import seaborn as sns
sns.set(style="ticks", color_codes=True)

g=sns.scatterplot(x="length", y="coverage", data=df, hue = 'Products', edgecolors=None, alpha = 0.7)
g.set(yscale="log")
plt.xlabel("Length(bp)")
plt.ylabel("Coverage")
plt.legend(loc = 'lower right')
plt.savefig('ATN_plot.png',dpi = 600)

元のデータ(部分):

contig  length  coverage    pathway Products
53  1230    2423    stigmatellin    Yes
58  1195    885 curacin Yes
65  1161    598 jamaicamide Yes
68  1159    8001    jamaicamide Yes
79  1113    1423    curacin Yes
105 1042    1106    stigmatellin    Yes
727 666 223 HSAF (heat stable antifungal factor)    Yes
787 655 37  curacin Yes
791 654 13  stigmatellin    Yes
798 652 49  stigmatellin    Yes
844 642 5774    jamaicamide Yes
89  1090    13  No  No
90  1089    10  No  No
91  1086    26  No  No
92  1080    16  No  No
93  1079    10  No  No
94  1079    13  No  No

そして、最終的なプロットは次のようになります。

enter image description here

スポットの白いエッジが好きではありません。ほとんどのスポットが蓄積されている画像の左下の部分が白く見えます。私はすでに "edgecolors = None"をコードに含めましたが、機能していないようです。誰かがエッジの色を削除したり、他の人に変更する方法を知っていますか?

どうもありがとうございました!

16
Steve Xu

置換edgecolors=Nonelinewidth=0

何かのようなもの:

g=sns.scatterplot(x="length", y="coverage", data=df, hue = 'Products', 
                  linewidth=0, alpha = 0.7)
17
Lucas

Matplotlibでは、ほとんどの引数は「デフォルトを使用」の場合と同様にNoneを取ります。これに対して、ここではデフォルトを使用するのではなく、エッジカラーを使用しません。これは"none"を介して行われます。

sns.scatterplot(..., edgecolor="none")

Kwargs(キーワード引数)を渡すことでスポットカラーを変更できます

kwargs  =   {'edgecolor':"r", # for Edge color
             'linewidth':2.7, # line width of spot
             'linestyle':'--', # line style of spot
            }
sns.scatterplot(x = "tip", y = "total_bill", data = tips_df, hue = "sex", 
                size ="sex", sizes = (100, 300), palette = "nipy_spectral" ,**kwargs)

または、次のようにパラメータとして直接渡すことができます。

sns.scatterplot(x = "tip", y = "total_bill", data = tips_df, hue = "sex", 
                size ="sex", sizes = (100, 300), palette = "nipy_spectral",
                edgecolor='r',
                linewidth=2,
                linestyle='--',)

出力>>>

enter image description here

私はあなたの疑いを明確にしたと思います。

4
Rudra Mohan