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Dockerfileにpandasをインストールします

Dockerイメージを作成しようとしています。 Dockerfileは次のとおりです。

# Use the official Python 3.6.5 image
FROM python:3.6.5-Alpine3.7

# Set the working directory to /app
WORKDIR /app

# Get the 
COPY requirements.txt /app
RUN pip3 install --no-cache-dir -r requirements.txt

# Configuring access to Jupyter
RUN mkdir /notebooks
RUN jupyter notebook --no-browser --ip 0.0.0.0 --port 8888 /notebooks

Requirements.txtファイルは次のとおりです。

jupyter
numpy==1.14.3
pandas==0.23.0rc2
scipy==1.0.1
scikit-learn==0.19.1
pillow==5.1.1
matplotlib==2.2.2
seaborn==0.8.1

コマンドdocker build -t standard .を実行すると、Dockerがパンダをインストールしようとしたときにエラーが発生します。エラーは次のとおりです。

Collecting pandas==0.23.0rc2 (from -r requirements.txt (line 3))
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/46/5c/a883712dad8484ef907a2f42992b122acf2bcecbb5c2aa751d1033908502/pandas-0.23.0rc2.tar.gz (12.5MB)
    Complete output from command python setup.py Egg_info:
    /bin/sh: svnversion: not found
    /bin/sh: svnversion: not found
    non-existing path in 'numpy/distutils': 'site.cfg'
    Could not locate executable gfortran
    ... (loads of other stuff)
    Command "python setup.py Egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-install-xb6f6a5o/pandas/
The command '/bin/sh -c pip3 install --no-cache-dir -r requirements.txt' returned a non-zero code: 1

以前のバージョンのpandas == 0.22.0をインストールしようとすると、次のエラーが発生します。

Step 5/7 : RUN pip3 install --no-cache-dir -r requirements.txt
 ---> Running in 5810ea896689
Collecting jupyter (from -r requirements.txt (line 1))
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/83/df/0f5dd132200728a86190397e1ea87cd76244e42d39ec5e88efd25b2abd7e/jupyter-1.0.0-py2.py3-none-any.whl
Collecting numpy==1.14.3 (from -r requirements.txt (line 2))
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/b0/2b/497c2bb7c660b2606d4a96e2035e92554429e139c6c71cdff67af66b58d2/numpy-1.14.3.Zip (4.9MB)
Collecting pandas==0.22.0 (from -r requirements.txt (line 3))
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/08/01/803834bc8a4e708aedebb133095a88a4dad9f45bbaf5ad777d2bea543c7e/pandas-0.22.0.tar.gz (11.3MB)
  Could not find a version that satisfies the requirement Cython (from versions: )
No matching distribution found for Cython
The command '/bin/sh -c pip3 install --no-cache-dir -r requirements.txt' returned a non-zero code: 1

私もパンダの前にサイフォンとsetuptoolsをインストールしようとしましたが、pip3 install pandas行で同じNo matching distribution found for Cythonエラーが発生しました。

pandasをインストールする方法を教えてください。

pythonpandasdockerdockerfilepython-3.6
9
ccasimiro9444

これでDockerイメージを作成できました。 FROM python:3.6.5-Alpine3.7とパンダの間にはいくつかのバージョンの非互換性があったに違いありません。 PythonバージョンをFROM python:3に変更しましたが、正常に機能しました（pillowバージョンを5.1.0にダウングレードする必要もありました）。

1
ccasimiro9444

Alpineには、デフォルトではビルドツールが含まれていません。ビルドツールをインストールし、ロケールのシンボリックリンクを作成します。

$ apk add --update curl gcc g++
$ ln -s /usr/include/locale.h /usr/include/xlocale.h
$ pip install numpy

https://wired-world.com/?p=1 に基づく

5
Aviv Sela

私はこの質問に答えたことに気づきましたが、最近、numpyとpandas dockerized projectとの依存関係に関して同様の問題がありました。とはいえ、これは未来。

私の解決策：

Aviv Sela で指摘されているように、Alpineにはデフォルトでビルドツールが含まれていないため、Dockerfileを介して追加する必要があります。したがって、numpyおよびpandasをコンテナーのAlpineに正常にインストールするために必要なビルドパッケージを含む以下のDockerfileを参照してください。

FROM python:3.6-Alpine3.7

RUN apk add --no-cache --update \
    python3 python3-dev gcc \
    gfortran musl-dev g++ \
    libffi-dev openssl-dev \
    libxml2 libxml2-dev \
    libxslt libxslt-dev \
    libjpeg-turbo-dev zlib-dev

RUN pip install --upgrade pip

ADD requirements.txt .
RUN pip install -r requirements.txt

Requirements.txt

numpy==1.17.1
pandas==0.25.1
3
kevayacht

おそらく、ベースPythonではなくpandasイメージから構築するほうがよいでしょう。パンダを再インストールする必要がないため、これにより反復がより速く簡単になるはずです。私は好きです。 amancevince/pandas（ https://hub.docker.com/r/amancevice/pandas/tags ）すべてのpandasタグで利用可能なAlpineおよびDebianイメージがあります、ただし、これらはすべてpython 3.7になっている可能性があります。

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Rebeku