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Pandasを使用して、行の長さが変化するdataFrameにCSVを読み込みます

だから私はこのように見えるCSVを持っています:

1 | 01-01-2019 | 724
2 | 01-01-2019 | 233 | 436
3 | 01-01-2019 | 345
4 | 01-01-2019 | 803 | 933 | 943 | 923 | 954
5 | 01-01-2019 | 454
...

また、次のコードを使用してdataFrameを生成しようとすると、.

df = pd.read_csv('data.csv', header=0, engine='c', error_bad_lines=False)

3列の行のみをdfに追加します(上から1、3、5行)

残りは「不良行」と見なされ、次のエラーが表示されます。

Skipping line 17467: expected 3 fields, saw 9

空のセルにnullを入力するだけで、csvにallデータを含むデータフレームを作成するにはどうすればよいですか?または、dfに追加する前に行の最大長を宣言する必要がありますか?

ありがとう!

7
caaax

Python csvを使用してデータをインポートし、グルーミングをフォーマットすることを検討してください。カスタムの方言を実装して、さまざまなcsv-nessを処理できます。

import csv
import pandas as pd

csv_data = """1 | 01-01-2019 | 724
2 | 01-01-2019 | 233 | 436
3 | 01-01-2019 | 345
4 | 01-01-2019 | 803 | 933 | 943 | 923 | 954
5 | 01-01-2019 | 454"""

with open('test1.csv', 'w') as f:
    f.write(csv_data)

csv.register_dialect('PipeDialect', delimiter='|')
with open('test1.csv') as csvfile:
    data = [row for row in csv.reader(csvfile, 'PipeDialect')]
df = pd.DataFrame(data = data)

Csvインポート方言と次のDataFrameを提供します。

    0             1      2      3      4      5     6
0  1    01-01-2019     724   None   None   None  None
1  2    01-01-2019    233     436   None   None  None
2  3    01-01-2019     345   None   None   None  None
3  4    01-01-2019    803    933    943    923    954
4  5    01-01-2019     454   None   None   None  None

演習として、入力ファイルの空白のパディングを処理します。

1
Rich Andrews

固定幅の読み取りが機能するはずです:

_from io import StringIO

s = '''1  01-01-2019  724
2  01-01-2019  233  436
3  01-01-2019  345
4  01-01-2019  803  933  943  923  954
5  01-01-2019  454'''


pd.read_fwf(StringIO(s), header=None)

   0           1    2      3      4      5      6
0  1  01-01-2019  724    NaN    NaN    NaN    NaN
1  2  01-01-2019  233  436.0    NaN    NaN    NaN
2  3  01-01-2019  345    NaN    NaN    NaN    NaN
3  4  01-01-2019  803  933.0  943.0  923.0  954.0
4  5  01-01-2019  454    NaN    NaN    NaN    NaN
_

またはdelimiterパラメータを使用

_s = '''1 | 01-01-2019 | 724
2 | 01-01-2019 | 233 | 436
3 | 01-01-2019 | 345
4 | 01-01-2019 | 803 | 933 | 943 | 923 | 954
5 | 01-01-2019 | 454'''


pd.read_fwf(StringIO(s), header=None, delimiter='|')

   0             1    2      3      4      5      6
0  1   01-01-2019   724    NaN    NaN    NaN    NaN
1  2   01-01-2019   233  436.0    NaN    NaN    NaN
2  3   01-01-2019   345    NaN    NaN    NaN    NaN
3  4   01-01-2019   803  933.0  943.0  923.0  954.0
4  5   01-01-2019   454    NaN    NaN    NaN    NaN
_

実際のファイルではStringIOを使用しないことに注意してください。ファイルパスに置き換えてください:pd.read_fwf('data.csv', delimiter='|', header=None)

1
Chris

csvファイルの先頭に列を追加します(空またはそれ以外)。 Pandasは、最初の行をデフォルトのサイズとして使用し、その下にあるものはすべてNaN値を持ちます。例:

file.csv:

a,b,c,d,e
1,2,3
3
2,3,4

コード:

>>> import pandas as pd
>>> pd.read_csv('file.csv')
   a    b    c   d   e
0  1  2.0  3.0 NaN NaN
1  3  NaN  NaN NaN NaN
2  2  3.0  4.0 NaN NaN
1
jfaccioni
colnames= [str(i) for i in range(9)]
df = pd.read_table('data.csv', header=None, sep=',', names=colnames)

変化する 9 colnames in number xコードでエラーが発生した場合

Skipping line 17467: expected 3 fields, saw x
0
phoenixio