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pip install numpyの問題-RuntimeError：Broken toolchain：シンプルなCプログラムをリンクできません

Numpy（およびscipyとmatplotlib）をvirturalenvにインストールしようとしています。

しかし、これらのエラーが引き続き発生します：

RuntimeError: Broken toolchain: cannot link a simple C program

----------------------------------------
Cleaning up...
Command python setup.py Egg_info failed with error code 1

Xcodeのコマンドラインツールがインストールされています

$ which gcc
/usr/bin/gcc
$ which cc
/usr/bin/cc

私はMac OSX 10.9を使用しています

編集
はい、pipでインストールしようとしています。
トレースバック全体が巨大です（> 400行）

以下にそのセクションを示します。

C compiler: cc -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -Arch x86_64 -Arch i386 -g -Os -pipe -fno-common -fno-strict-aliasing -fwrapv -mno-fused-madd -DENABLE_DTRACE -DMACOSX -DNDEBUG -Wall -Wstrict-prototypes -Wshorten-64-to-32 -DNDEBUG -g -fwrapv -Os -Wall -Wstrict-prototypes -DENABLE_DTRACE -Arch x86_64 -Arch i386 -pipe



compile options: '-Inumpy/core/src/private -Inumpy/core/src -Inumpy/core -Inumpy/core/src/npymath -Inumpy/core/src/multiarray -Inumpy/core/src/umath -Inumpy/core/src/npysort -Inumpy/core/include -I/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7 -c'

cc: _configtest.c

clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]

clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future

clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]

clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future

failure.

removing: _configtest.c _configtest.o

Traceback (most recent call last):

  File "<string>", line 17, in <module>

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/setup.py", line 192, in <module>

    setup_package()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/setup.py", line 185, in setup_package

    configuration=configuration )

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/core.py", line 169, in setup

    return old_setup(**new_attr)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/core.py", line 152, in setup

    dist.run_commands()

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 953, in run_commands

    self.run_command(cmd)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/Egg_info.py", line 10, in run

    self.run_command("build_src")

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/cmd.py", line 326, in run_command

    self.distribution.run_command(command)

  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/distutils/dist.py", line 972, in run_command

    cmd_obj.run()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 153, in run

    self.build_sources()

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 164, in build_sources

    self.build_library_sources(*libname_info)

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 299, in build_library_sources

    sources = self.generate_sources(sources, (lib_name, build_info))

  File "/Users/bdhammel/Documents/research_programming/Julia_env/build/numpy/numpy/distutils/command/build_src.py", line 386, in generate_sources

    source = func(extension, build_dir)

  File "numpy/core/setup.py", line 674, in get_mathlib_info

    raise RuntimeError("Broken toolchain: cannot link a simple C program")

RuntimeError: Broken toolchain: cannot link a simple C program
pythonnumpyvirtualenvpip
75
Ben

いですが、動作するようです

Sudo ARCHFLAGS=-Wno-error=unused-command-line-argument-hard-error-in-future pip install --upgrade numpy

Numpy以外のパッケージ（lxmlなど）でこのエラーが発生する場合、コマンドの最後にnumpyの代わりにそのパッケージ名を指定してください。

私は誰かがgemのインストールで持っていた同様の問題を見ました

Ruby GemのインストールJaveはMavericksおよびXcode 5.1で失敗します-不明な引数： '-multiply_definedsuppress'

これは一時的な修正であり、ある時点でコンパイラオプションを修正する必要があります。

73
Derrick Shoemake

Docker（Alpine）およびPython 3.xの場合、これでうまくいきました。

RUN apk update
RUN apk add make automake gcc g++ Subversion python3-dev
38
Willem Bressers

問題は、コンパイルできないことです。

まず、Xcodeの新しい利用規約に同意したことを確認してください。これを行うには、xCodeを開いて受け入れます。

次に、gccをインストールしてみてください

brew install gcc

最後に、Numpyのインストールを試みます

pip install numpy

お役に立てれば。

14
Desmond

Sudoを使用したくない場合（したがって、venvを使用する際に権限などが保持されます）、ARCHFLAGS宣言を.bash_profileに追加して、通常どおり実行できます。これは、Mavericksとvenvを使用したXcode 5.1で機能しました。

〜/ .bash_profileで：

export ARCHFLAGS = -Wno-error = unused-command-line-argument-hard-error-in-future

次に、コマンドを実行します。

pip install --upgrade numpy

9
Brian

XCodeを開いて契約書に同意し、ツールをインストールするだけでした。その後、PyCharmに戻り、numpyを問題なく再インストールしました。

5
user3589327

同様の問題を抱えているFedoraユーザーの場合、パッケージをインストールしてみてください。

（python3を使用しない場合は、pip3の代わりにpython-develとpipを使用してください）

Sudo dnf install python3-devel
Sudo dnf install make automake gcc gcc-c++ gcc-gfortran
Sudo dnf install redhat-rpm-config
Sudo dnf install Subversion

してみて

Sudo pip3 install numpy
4
Ollegn

Linuxディストリビューションを実行している場合、特にsh: gcc: command not foundのような明確なログ行が表示される場合は、Cコンパイラが必要になる場合があります。 here の指示に従うことができます。これについては以下にまとめました。

  • Fedora、Red Hat、CentOS、またはScientific Linux

    # yum groupinstall 'Development Tools'

  • DebianまたはUbuntu Linux

    $ Sudo apt-get update $ Sudo apt-get install build-essential manpages-dev

その後、再実行してみてください：

Sudo pip install numpy
4
avyk37

OS XがXCodeをアップグレードした後、場合によっては、XCodeはユーザー（管理者特権）に新しいライセンスの受け入れを要求します。ライセンスが受け入れられるまで、clangおよびgccはコードをコンパイルおよびリンクしようとするとエラーを発行します。または、少なくともpythonパッケージ。

XCodeを起動してライセンスに同意すると、エラーは表示されなくなります。

少なくとも、私にはそうでした。

2
lukecampbell

上記はpython3-devをインストールして初めて機能しました。

0
Iliyan Bobev

Fedora 22では、これはpip自体を更新することで解決されました：Sudo pip install --upgrade pip

0
zenperttu

これは、Cコンパイラが見つからないことを意味します。他のコンパイラのリンクに失敗した場合は、gccコンパイラをインストールしてみてください。

0
Inc33