web-dev-qa-db-ja.com

Sparkデータフレーム列の最大値を取得する最良の方法

Sparkデータフレーム列の最大値を取得する最良の方法を見つけようとしています。

次の例を考えてみましょう。

df = spark.createDataFrame([(1., 4.), (2., 5.), (3., 6.)], ["A", "B"])
df.show()

作成するもの:

+---+---+
|  A|  B|
+---+---+
|1.0|4.0|
|2.0|5.0|
|3.0|6.0|
+---+---+

私の目標は、列Aで最大値を見つけることです(検査により、これは3.0です)。 PySparkを使用して、私が考えることができる4つのアプローチがあります:

# Method 1: Use describe()
float(df.describe("A").filter("summary = 'max'").select("A").collect()[0].asDict()['A'])

# Method 2: Use SQL
df.registerTempTable("df_table")
spark.sql("SELECT MAX(A) as maxval FROM df_table").collect()[0].asDict()['maxval']

# Method 3: Use groupby()
df.groupby().max('A').collect()[0].asDict()['max(A)']

# Method 4: Convert to RDD
df.select("A").rdd.max()[0]

上記のそれぞれが正しい答えを提供しますが、Sparkプロファイリングツールがない場合、どちらが最適かを判断できません。

上記の方法のどれがSparkランタイムまたはリソースの使用に関して最も効率的であるか、または上記のものよりも直接的な方法があるかどうかについて、直観または経験主義からのアイデアはありますか?

46
xenocyon
>df1.show()
+-----+--------------------+--------+----------+-----------+
|floor|           timestamp|     uid|         x|          y|
+-----+--------------------+--------+----------+-----------+
|    1|2014-07-19T16:00:...|600dfbe2| 103.79211|71.50419418|
|    1|2014-07-19T16:00:...|5e7b40e1| 110.33613|100.6828393|
|    1|2014-07-19T16:00:...|285d22e4|110.066315|86.48873585|
|    1|2014-07-19T16:00:...|74d917a1| 103.78499|71.45633073|

>row1 = df1.agg({"x": "max"}).collect()[0]
>print row1
Row(max(x)=110.33613)
>print row1["max(x)"]
110.33613

答えはmethod3とほぼ同じです。しかし、method3の「asDict()」は削除できるようです

45
Burt

データフレームの特定の列の最大値は、次を使用して実現できます-

your_max_value = df.agg({"your-column": "max"}).collect()[0][0]

15

注:Sparkは、ビッグデータ(分散コンピューティング)で動作することを目的としています。サンプルのDataFrameのサイズは非常に小さいため、実際のサンプルの順序は、小さい〜の例に関して変更できます。

最も遅い:Method_1、.describe( "A")がmin、max、mean、stddev、およびcountを計算するため(列全体で5回の計算)

中:Method_4。これは、.rdd(DFからRDDへの変換)によりプロセスが遅くなるためです。

Faster:Method_3〜Method_2〜method_5。ロジックが非常に似ているため、SparkのCatalystオプティマイザーは、最小限の操作で特定の列の最大値を取得し、単一値データフレームを収集する非常に類似したロジックに従います。 (.asDict()は3,2と5を比較するために少し余分な時間を追加します)

import pandas as pd
import time

time_dict = {}

dfff = self.spark.createDataFrame([(1., 4.), (2., 5.), (3., 6.)], ["A", "B"])
#--  For bigger/realistic dataframe just uncomment the following 3 lines
#lst = list(np.random.normal(0.0, 100.0, 100000))
#pdf = pd.DataFrame({'A': lst, 'B': lst, 'C': lst, 'D': lst})
#dfff = self.sqlContext.createDataFrame(pdf)

tic1 = int(round(time.time() * 1000))
# Method 1: Use describe()
max_val = float(dfff.describe("A").filter("summary = 'max'").select("A").collect()[0].asDict()['A'])
tac1 = int(round(time.time() * 1000))
time_dict['m1']= tac1 - tic1
print (max_val)

tic2 = int(round(time.time() * 1000))
# Method 2: Use SQL
dfff.registerTempTable("df_table")
max_val = self.sqlContext.sql("SELECT MAX(A) as maxval FROM df_table").collect()[0].asDict()['maxval']
tac2 = int(round(time.time() * 1000))
time_dict['m2']= tac2 - tic2
print (max_val)

tic3 = int(round(time.time() * 1000))
# Method 3: Use groupby()
max_val = dfff.groupby().max('A').collect()[0].asDict()['max(A)']
tac3 = int(round(time.time() * 1000))
time_dict['m3']= tac3 - tic3
print (max_val)

tic4 = int(round(time.time() * 1000))
# Method 4: Convert to RDD
max_val = dfff.select("A").rdd.max()[0]
tac4 = int(round(time.time() * 1000))
time_dict['m4']= tac4 - tic4
print (max_val)

tic5 = int(round(time.time() * 1000))
# Method 4: Convert to RDD
max_val = dfff.agg({"A": "max"}).collect()[0][0]
tac5 = int(round(time.time() * 1000))
time_dict['m5']= tac5 - tic5
print (max_val)

print time_dict

クラスターのエッジノードでの結果(ミリ秒(ms)):

small DF(ms):{'m1':7096、 'm2':205、 'm3':165、 'm4':211、 'm5':180}

より大きいDF(ms):{'m1':10260、 'm2':452、 'm3':465、 'm4':916、 'm5':373}

12

別の方法:

df.select(f.max(f.col("A")).alias("MAX")).limit(1).collect()[0].MAX

私のデータでは、このベンチマークを取得しました:

df.select(f.max(f.col("A")).alias("MAX")).limit(1).collect()[0].MAX
CPU times: user 2.31 ms, sys: 3.31 ms, total: 5.62 ms
Wall time: 3.7 s

df.select("A").rdd.max()[0]
CPU times: user 23.2 ms, sys: 13.9 ms, total: 37.1 ms
Wall time: 10.3 s

df.agg({"A": "max"}).collect()[0][0]
CPU times: user 0 ns, sys: 4.77 ms, total: 4.77 ms
Wall time: 3.75 s

それらはすべて同じ答えを与えます

8
luminousmen

Scalaを使用して(Spark 2.0。+を使用して)実行する方法がわからない場合は、次のようにします。

scala> df.createOrReplaceTempView("TEMP_DF")
scala> val myMax = spark.sql("SELECT MAX(x) as maxval FROM TEMP_DF").
    collect()(0).getInt(0)
scala> print(myMax)
117
3
Boern

私はhead()を使用することが最善の解決策であると信じています

あなたの例を考えてみましょう:

+---+---+
|  A|  B|
+---+---+
|1.0|4.0|
|2.0|5.0|
|3.0|6.0|
+---+---+

pythonのaggおよびmaxメソッドを使用すると、次のように値を取得できます。

from pyspark.sql.functions import max df.agg(max(df.A)).head()[0]

これは以下を返します:3.0

正しいインポートがあることを確認してください。
from pyspark.sql.functions import maxここで使用するmax関数は、pySPark sqlライブラリ関数であり、pythonのデフォルトのmax関数ではありません。

1

pysparkではこれを行うことができます:

max(df.select('ColumnName').rdd.flatMap(lambda x: x).collect())
1
Grant Shannon

以下の例は、Sparkデータフレーム列の最大値を取得する方法を示しています。

from pyspark.sql.functions import max

df = sql_context.createDataFrame([(1., 4.), (2., 5.), (3., 6.)], ["A", "B"])
df.show()
+---+---+
|  A|  B|
+---+---+
|1.0|4.0|
|2.0|5.0|
|3.0|6.0|
+---+---+

result = df.select([max("A")]).show()
result.show()
+------+
|max(A)|
+------+
|   3.0|
+------+

print result.collect()[0]['max(A)']
3.0

同様に、以下に示すように、最小値、平均値などを計算できます。

from pyspark.sql.functions import mean, min, max

result = df.select([mean("A"), min("A"), max("A")])
result.show()
+------+------+------+
|avg(A)|min(A)|max(A)|
+------+------+------+
|   2.0|   1.0|   3.0|
+------+------+------+
1
Nandeesh

統計の計算を行うだけで、これを行う怠zyな方法を次に示します。

df.write.mode("overwrite").saveAsTable("sampleStats")
Query = "ANALYZE TABLE sampleStats COMPUTE STATISTICS FOR COLUMNS " + ','.join(df.columns)
spark.sql(Query)

df.describe('ColName')

または

spark.sql("Select * from sampleStats").describe('ColName')

または、Hive Shellを開いて、

describe formatted table sampleStats;

プロパティに統計が表示されます-min、max、distinct、nullなど。

0
user 923227
import org.Apache.spark.sql.SparkSession
import org.Apache.spark.sql.functions._

val testDataFrame = Seq(
  (1.0, 4.0), (2.0, 5.0), (3.0, 6.0)
).toDF("A", "B")

val (maxA, maxB) = testDataFrame.select(max("A"), max("B"))
  .as[(Double, Double)]
  .first()
println(maxA, maxB)

結果は(3.0,6.0)で、これはtestDataFrame.agg(max($"A"), max($"B")).collect()(0)と同じです。ただし、testDataFrame.agg(max($"A"), max($"B")).collect()(0)はリスト[3.0,6.0]を返します

0
hello-world