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sqliteデータベースを開いてpandas dataframeに変換する方法

いくつかのデータをsqliteデータベース(data.db)としてダウンロードしました。このデータベースをpythonで開き、それをpandas dataframe。

これは今のところ私がやったことです

import sqlite3
import pandas    
dat = sqlite3.connect('data.db') #connected to database with out error
pandas.DataFrame.from_records(dat, index=None, exclude=None, columns=None, coerce_float=False, nrows=None)

しかし、このエラーを投げる

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas/core/frame.py", line 980, in from_records
    coerce_float=coerce_float)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pandas/core/frame.py", line 5353, in _to_arrays
    if not len(data):
TypeError: object of type 'sqlite3.Connection' has no len()

Sqliteデータベースをpandas dataframeに変換する方法

29
Eka

SqliteはPython Standard Libraryの一部であり、SQLiteデータベースへの素晴らしく簡単なインターフェースですが、Pandas=チュートリアルの状態:

注read_sql_table()を使用するには、SQLAlchemyのオプションの依存関係がインストールされている必要があります。 http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html#reading-tables

ただし、SQLAlchemyのインストールを避けたい場合、Pandasはsqlite3アクセスを引き続きサポートします。

import sqlite3
import pandas as pd
# Create your connection.
cnx = sqlite3.connect('file.db')

df = pd.read_sql_query("SELECT * FROM table_name", cnx)

ただし、使用するテーブルの名前を事前に知る必要があります。

それが役に立てば幸い!

http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/io.html#sqlite-fallback

58
Mike

この線

dat = sqlite3.connect('data.db')

データベースへの接続を開きます。これまでに照会されたレコードはありません。したがって、後でクエリを実行し、これをpandasデータフレームコンストラクターに提供する必要があります。

これに似ているはずです

import sqlite3
import pandas as pd

dat = sqlite3.connect('data.db')
query = dat.execute("SELECT * From <DATABASENAME>")
cols = [column[0] for column in query.description]
results= pd.DataFrame.from_records(data = query.fetchall(), columns = cols)

私はSQLコマンドにあまり自信がないので、クエリの正確さを確認する必要があります。データベース内のテーブルの名前にする必要があります。

5
RaJa

Googleでsqlalchemyengineおよびデータベース名(この場合はsqlite)を検索します。

import pandas as pd
import sqlalchemy

db_name = "data.db"
table_name = "LITTLE_BOBBY_TABLES"

engine = sqlalchemy.create_engine("sqlite:///%s" % db_name, execution_options={"sqlite_raw_colnames": True})
df = pd.read_sql_table(table_name, engine)
1
user3226167

データベースにデータを保存しました。sqliteテーブル名はReviewsです

import sqlite3
con=sqlite3.connect("database.sqlite")

data=pd.read_sql_query("SELECT * FROM Reviews",con)
print(data)
0
vignesh babu