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dplyr tbl列をベクトルとして抽出する

データベースバックエンドを持つtblから、dplyr tblの1列をベクトルとして取得するより簡潔な方法はありますか（つまり、データフレーム/テーブルを直接サブセット化することはできません）？

require(dplyr)
db <- src_sqlite(tempfile(), create = TRUE)
iris2 <- copy_to(db, iris)
iris2$Species
# NULL

それはあまりにも簡単だったので、

collect(select(iris2, Species))[, 1]
# [1] "setosa"     "setosa"     "setosa"     "setosa"  etc.

しかし、それは少し不器用なようです。

rdplyrlazy-evaluationcollect
140
nacnudus

Dplyr 0.7.0では、pullを使用してtblからベクトルを取得できます。


library("dplyr")
#> 
#> Attaching package: 'dplyr'
#> The following objects are masked from 'package:stats':
#> 
#>     filter, lag
#> The following objects are masked from 'package:base':
#> 
#>     intersect, setdiff, setequal, union
db <- src_sqlite(tempfile(), create = TRUE)
iris2 <- copy_to(db, iris)
vec <- pull(iris2, Species)
head(vec)
#> [1] "setosa" "setosa" "setosa" "setosa" "setosa" "setosa"
139
Lorenz Walthert

@nacnudusからのコメントによると、pull関数がdplyr 0.6で実装されたようです。

iris2 %>% pull(Species)

古いバージョンのdplyrの場合、列を少し引き出しやすくする（入力しやすく、読みやすくする）きちんとした関数を次に示します。

pull <- function(x,y) {x[,if(is.name(substitute(y))) deparse(substitute(y)) else y, drop = FALSE][[1]]}

これにより、次のいずれかを実行できます。

iris2 %>% pull('Species')
iris2 %>% pull(Species)
iris2 %>% pull(5)

その結果...

 [1] 21.0 21.0 22.8 21.4 18.7 18.1 14.3 24.4 22.8 19.2 17.8 16.4 17.3 15.2 10.4 10.4 14.7 32.4 30.4 33.9 21.5 15.5 15.2 13.3 19.2 27.3 26.0 30.4 15.8 19.7 15.0 21.4

また、データフレームでも正常に機能します。

> mtcars %>% pull(5)
 [1] 3.90 3.90 3.85 3.08 3.15 2.76 3.21 3.69 3.92 3.92 3.92 3.07 3.07 3.07 2.93 3.00 3.23 4.08 4.93 4.22 3.70 2.76 3.15 3.73 3.08 4.08 4.43
[28] 3.77 4.22 3.62 3.54 4.11

dplyrのv0.2でこれを行う良い方法：

iris2 %>% select(Species) %>% collect %>% .[[5]]

または、必要に応じて：

iris2 %>% select(Species) %>% collect %>% .[["Species"]]

または、テーブルが大きすぎない場合は、単に...

iris2 %>% collect %>% .[["Species"]]
84
Tommy O'Dell

unlistを使用することもできます。これは、列の名前を繰り返したり、インデックスを指定したりする必要がないため、読みやすくなっています。

iris2 %>% select(Species) %>% unlist(use.names = FALSE)
65
StanislawSwierc

magrittrのextract2便利な関数を使用します。

library(magrittr)
library(dplyr)

iris2 %>%
  select(Species) %>%
  extract2(1)
20
Hugh

私はおそらく書くでしょう：

collect(select(iris2, Species))[[1]]

Dplyrはデータのtblを操作するために設計されているため、データの単一の列を取得するより良い方法はありません。

20
hadley

@ Luke1018は、コメントの1つでこのソリューションを提案しました。

magrittrエクスポジション演算子（%$%）を使用して、データフレームからベクターをプルすることもできます。

例えば：

iris2 %>% select(Species) %>% collect() %$% Species

独自の答えに値すると思いました。

15
rrs