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Rの3つ以上のデータフレームを行名でマージする

4つのdfからデータを収集し、それらを行名でマージしたいと思います。これを行う効率的な方法を探しています。これは、私が持っているデータの簡略版です。

df1           <- data.frame(N= sample(seq(9, 27, 0.5), 40, replace= T),
                            P= sample(seq(0.3, 4, 0.1), 40, replace= T),
                            C= sample(seq(400, 500, 1), 40, replace= T))
df2           <- data.frame(Origin= sample(c("A", "B", "C", "D", "E"), 40,
                                           replace= T),
                            foo1= sample(c(T, F), 40, replace= T),
                            X= sample(seq(145600, 148300, 100), 40, replace= T),
                            Y= sample(seq(349800, 398600, 100), 40, replace= T))
df3           <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
df4           <- matrix(sample(seq(0, 1, 0.01), 40), 40, 100)
rownames(df1) <- paste("P", sprintf("%02d", c(1:40)), sep= "")
rownames(df2) <- rownames(df1)
rownames(df3) <- rownames(df1)
rownames(df4) <- rownames(df1)

これは私が通常行うことです：

# merge df1 and df2
dat           <- merge(df1, df2, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL  #remove added rownames col

# merge dat and df3
dat           <- merge(dat, df3, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL  #remove added rownames col

# merge dat and df4
dat           <- merge(dat, df4, by= "row.names", all.x= F, all.y= F) #merge
rownames(dat) <- dat$Row.names #reset rownames
dat$Row.names <- NULL #remove added rownames col

ご覧のとおり、これには多くのコードが必要です。私の質問は、同じ結果がより簡単な手段で達成できるかどうかです。私は試しました（成功せず）：更新：これは今すぐ動作します！

MyMerge       <- function(x, y){
  df            <- merge(x, y, by= "row.names", all.x= F, all.y= F)
  rownames(df)  <- df$Row.names
  df$Row.names  <- NULL
  return(df)
}
dat           <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))

提案を事前に感謝します

rmergedataframereducerowname
32
HDR

3行のコードでまったく同じ結果が得られます。

dat2 <- cbind(df1, df2, df3, df4)
colnames(dat2)[-(1:7)] <- paste(paste('V', rep(1:100, 2),sep = ''),
                            rep(c('x', 'y'), each = 100), sep = c('.'))
all.equal(dat,dat2)

ああ、今、あなたがなぜそんなに苦しんでいるのか理解しています。古いforループを使用すると、確実にトリックが実行されます。さらに賢い解決策があるかもしれません

rn <- rownames(df1)
l <- list(df1, df2, df3, df4)
dat <- l[[1]]
for(i in 2:length(l)) {
  dat <- merge(dat, l[[i]],  by= "row.names", all.x= F, all.y= F) [,-1]
  rownames(dat) <- rn
}
6
Edwin

join_all from plyrはおそらくあなたが望むことをするでしょう。しかし、それらはすべてデータフレームでなければならず、行名は列として追加されます

require(plyr)

df3 <- data.frame(df3)
df4 <- data.frame(df4)

df1$rn <- rownames(df1)
df2$rn <- rownames(df2)
df3$rn <- rownames(df3)
df4$rn <- rownames(df4)

df <- join_all(list(df1,df2,df3,df4), by = 'rn', type = 'full')

type引数は、行名が変化して一致しない場合でも役立ちます。行名が必要ない場合：

df$rn <- NULL
41
Anto

関数を編集して、特定の列キー（列の名前）により多くのデータフレームをマージできる関数を思いつきました。結果のデータフレームには、マージされたデータフレームのすべての変数が含まれます（共通変数のみを保持する場合（NAを除き、all.x= FALSE, all.y= FALSE）

MyMerge <- function(x, y){
  df <- merge(x, y, by= "name of the common column", all.x= TRUE, all.y= TRUE)
  return(df)
}
new.df <- Reduce(MyMerge, list(df1, df2, df3, df4))
13
Roxana Adam

私は同じ機能を探していました。ここと他の場所でいくつかのオプションを試した後。私にとって最も簡単なのは：

cbind.data.frame（df1、df2、df3、df4 ....）

7
Jorge