RStudioで新しいウィンドウを開くのではなく、プロットウィンドウペインにグラフィックを表示する
私はこれを無駄にグーグルで検索しました。プロットウィンドウにプロットを表示するのではなく、プロットまたはヒストグラムを印刷すると、プロットで新しいウィンドウが開くので、知らないうちにいくつかの設定を変更したに違いありません。新しいウィンドウのタイトルは「R Graphics：Device 2（ACTIVE）」です。
これは、一部のRStudioバージョンのR 3.3.0で発生した問題です。 RStudioでversionを使用してバージョンを確認できます。 RSudio 0.99.902で動作するはずです。
詳細については、 here を確認してください。
実行したコードによっては、おそらく新しいグラフィックデバイスがスタックにプッシュされた可能性があります。次の方法でオフにできます。
> dev.off()
出力デバイスの管理に関するRドキュメント を参照してください。