編集：私は考え直して、私は質問を誤解しているかもしれないことに気づきました。ディレクトリを特定のユーザーのみに表示したい場合（つまり、他のすべてのユーザーの場合、そのリストはディレクトリリストに表示されません）、他のユーザーが親ディレクトリ。したがって、ディレクトリが/foo/barの場合、/fooのr権限を削除して（所有者以外のすべてのユーザー）、他のユーザーが/fooの内容を一覧表示できないようにすることができますが、具体的に/foo/barを非表示にすることはできません（ただし、その内容を確実に非表示にすることはできます）。
古い答え：
その特定のユーザーをディレクトリの所有者にし、所有者以外のすべてのユーザーのそのディレクトリに対するすべての権限を削除します。シェルでは、chmodを使用してこれを行います。
chmod 700 the_directory
ファイルマネージャーを使用している場合は、「ユーザー」列のチェックマークを除いて、permissions-tabのすべてのチェックマークを削除してください（詳細はもちろんファイルマネージャーによって異なります）。
これをGUIから行う場合は、GNOMEファイルブラウザー（Nautilusとして知られている）のヘルプで説明されています。
基本的には、フォルダを選択し、メニューから[ファイル]-> [プロパティ]-> [権限]を選択します。
それ以外の場合は、sepp2kの答えは完全に正しいです。UNIXファイルのアクセス許可の詳細な説明に興味がある場合は、txwikingerのリンクが最適です。
このチュートリアル は、Linux（およびUbuntu）でファイルのアクセス許可を設定して、アクセスを制御できるようにする方法を詳細に説明しています。