web-dev-qa-db-ja.com

numpy.matrixまたは配列をScipyのスパース行列に変換する方法

SciPyスパース行列の場合、todense()またはtoarray()を使用してNumPy行列または配列に変換できます。逆を行う関数は何ですか？

私は検索しましたが、どのキーワードが正しいヒットになるべきかわかりませんでした。

pythonnumpyscipysparse-matrix
62
Flake

スパース行列を初期化するときに、numpy配列または行列を引数として渡すことができます。たとえば、CSRマトリックスの場合、次のことができます。

>>> import numpy as np
>>> from scipy import sparse
>>> A = np.array([[1,2,0],[0,0,3],[1,0,4]])
>>> B = np.matrix([[1,2,0],[0,0,3],[1,0,4]])

>>> A
array([[1, 2, 0],
       [0, 0, 3],
       [1, 0, 4]])

>>> sA = sparse.csr_matrix(A)   # Here's the initialization of the sparse matrix.
>>> sB = sparse.csr_matrix(B)

>>> sA
<3x3 sparse matrix of type '<type 'numpy.int32'>'
        with 5 stored elements in Compressed Sparse Row format>

>>> print sA
  (0, 0)        1
  (0, 1)        2
  (1, 2)        3
  (2, 0)        1
  (2, 2)        4
101
David Alber

Scipyにはいくつかの疎行列クラスがあります。

bsr_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy、blocksize]）ブロックスパース行行列
coo_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）COOrdinate形式のスパース行列。
csc_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）圧縮スパース列行列
csr_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）圧縮されたスパース行行列
dia_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）DIAgonalストレージを持つスパース行列
dok_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）キーに基づく辞書ベースのスパース行列。
lil_matrix（arg1 [、shape、dtype、copy]）行ベースのリンクリストスパース行列

それらのいずれも変換を行うことができます。

import numpy as np
from scipy import sparse
a=np.array([[1,0,1],[0,0,1]])
b=sparse.csr_matrix(a)
print(b)

(0, 0)  1
(0, 2)  1
(1, 2)  1

http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/sparse.html#usage-information を参照してください。

20
cyborg

逆関数については、関数はinv(A)ですが、巨大な行列の場合は非常に計算コストがかかり不安定になるため、使用することはお勧めしません。代わりに、逆の近似値を使用する必要があります。または、Ax = bを解く場合、Aは本当に必要ありません。-1。

0
Fernando Bastos García