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reshape2のMeltが変換で行名をキャプチャできないのはなぜですか？

次のデータがあります。

Cubn    3.71455160837536    0.237454645363458
Gm9779  2.56051657980096    0.20850752817264
Apod    3.51796703048962    0.195999214485821

私がしたいのは、これを与えるような「溶けた」データを作成することです

       var1 var2     value
1      FOO Cubn   3.7145516
2      FOO Gm9779 2.5605166
3      FOO Apod   3.5179670
4      BAR Cubn   0.2374546
5      BAR Gm9779 0.2085075
6      BAR Apod   0.1959992

しかし、なぜこれが失敗したのですか？

 library("reshape2");
 dat <-read.table("http://dpaste.com/1446132/plain/",header=FALSE)
 rownames(dat) <- dat[,1]
 dat[,1] <- NULL
 colnames(dat) <- c("FOO","BAR");
 head(dat)
 longData <- melt(dat);
 head(longData)
rreshapereshape2
27
neversaint

なぜの部分はわかりませんが、data.frameの代わりにmeltingをmatrixにすることで行名を取得できることは知っています。

melt(as.matrix(dat))
#     Var1 Var2     value
# 1   Cubn  FOO 3.7145516
# 2 Gm9779  FOO 2.5605166
# 3   Apod  FOO 3.5179670
# 4   Cubn  BAR 0.2374546
# 5 Gm9779  BAR 0.2085075
# 6   Apod  BAR 0.1959992

melt関数のコードを調べて、このように動作する理由を知る必要があります。特に、reshape2:::melt.matrixのコードには次の行があり、上記の例の最初の2列を作成します。

labels <- expand.grid(lapply(dn, var.convert), KEEP.OUT.ATTRS = FALSE, 
    stringsAsFactors = FALSE)
50
A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1